1998年物理实验中心成立时，确立的工作思路是：尊重学生的认知规律，促进学生心理素质健康发展，服务学生实践应用能力和科学创新能力的培养，引入科学研究理念，建立符合多样化人才培养规格的实验教学体系；优化教学资源和教学环境；完善运行机制和管理体制；加强实验教学队伍建设，努力提高实验教学水平和实验教学质量，把物理实验中心建设成现代化高水平的实践基地。

2001年我校光电研究所的“量子光学与光量子器件实验室”获准为国家重点实验室。对上述工作思路作了适当修正，明确提出从“从实验教学思想、实验教学内容体系、实验教学过程、实验教学方法、实验室仪器配置、实验室运行机制、实验队伍建设等方面全面依托国家重点实验室，把物理实验中心建设成现代化高水平的实践基地”。